Protein–RNA interactions for Protein: E9QAG4

4930522L14Rik, RIKEN cDNA 4930522L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930522L14RikE9QAG4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930522L14RikE9QAG4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930522L14RikE9QAG4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms