Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Usp17lbE9Q9U0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lbE9Q9U0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17lbE9Q9U0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17lbE9Q9U0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Usp17lbE9Q9U0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Usp17lbE9Q9U0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Usp17lbE9Q9U0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp17lbE9Q9U0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lbE9Q9U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lbE9Q9U0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lbE9Q9U0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lbE9Q9U0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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