Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aknad1E9Q8N6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aknad1E9Q8N6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms