Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col22a1E9Q7P1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col22a1E9Q7P1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms