Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms