Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20518E9Q548 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms