Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r238E9Q373 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r238E9Q373 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms