Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcc4E9Q236 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcc4E9Q236 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcc4E9Q236 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcc4E9Q236 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Abcc4E9Q236 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcc4E9Q236 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc4E9Q236 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc4E9Q236 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcc4E9Q236 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms