Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930426L09RikE9Q0N7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms