Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms