Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Herc1E9PZP8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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