Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd2E9PZM4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd2E9PZM4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms