Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp4E9PYK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms