Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931408C20RikE9PWP9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms