Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttc17E9PVB5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms