Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syde2E9PUP1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde2E9PUP1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms