Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rdh8D3Z6W3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms