Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hfm1D3Z4R1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hfm1D3Z4R1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hfm1D3Z4R1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms