Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4D4

1700064H15Rik, RIKEN cDNA 1700064H15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700064H15RikD3Z4D4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700064H15RikD3Z4D4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700064H15RikD3Z4D4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms