Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3543D3Z235 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3543D3Z235 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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