Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf217D3YYI7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms