Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC048679D3YXE9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms