Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ptprz1B9EKR1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms