Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CatipB9EKE5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CatipB9EKE5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CatipB9EKE5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms