Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms