Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pnldc1B2RXZ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms