Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia1B2RXQ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ppfia1B2RXQ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms