Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr3aB2RXC6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr3aB2RXC6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms