Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3lB2RV38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms