Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Abcc8B2RUS7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abcc8B2RUS7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Abcc8B2RUS7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms