Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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