Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apba1B2RUJ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms