Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprbB2RU80 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprbB2RU80 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms