Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Otud4B2RRE7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms