Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms