Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf3B2RQG2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf3B2RQG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms