Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plekhd1B2RPU2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plekhd1B2RPU2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms