Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn7aB1AYL1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms