Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms