Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NhsB1AV60 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NhsB1AV60 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NhsB1AV60 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms