Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spocd1B1ASB6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spocd1B1ASB6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms