Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms