Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr29B1ARI9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms