Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfn8B1ARD8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms