Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp36B1AQJ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms