Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4aA2BI40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4aA2BI40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms