Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper2A2ARP9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper2A2ARP9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Catsper2A2ARP9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Catsper2A2ARP9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Catsper2A2ARP9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms