Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SetxA2AKX3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SetxA2AKX3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms