Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc183A2AJB1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc183A2AJB1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc183A2AJB1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms