Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap5A2AGT5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms